طرح مسأله: در این مقاله به بررسی نظری کارکرد سازمان‌های غیردولتی با تأکید بر سازمان‌های غیردولتی فعال در زمینه مسائل زیست‌محیطی پرداخته می‌شود. روش: این مطالعه توصیفی است و بر پایه اسناد موجود و مصاحبه با 50 نفر اعضای فعال سازمان‌های غیردولتی زیست محیطی اطلاعات موجود گردآوری و تحلیل شده‌اند. یافته‌ها: بررسی عملکرد سازمان‌های غیردولتی زیست‌محیطی حکایت از مشکلات ساختاری و سازمانی این سازمان‌ها در ابعاد اجتماعی، اقتصادی، سیاسی و حقوقی دارد. ابهام در مجموعه قوانین و مقررات این سازمان‌ها، ضعف در مهارت‌های مدیریتی حاکم بر آن‌ها، دخالت دولت و گروه‌های ذی‌نفوذ سیاسی در فعالیت‌های آنان از اهم مشکلات این سازمان‌ها به شمار می‌آیند. نتایج: بررسی مبانی نظری حاکم بر رفتارهای سازمان‌های غیردولتی در جهان و ارزیابی جایگاه و کارکرد سازمان‌های غیردولتی در ایران نشان‌دهنده محدویت‌های ساختاری و سازمانی حاکم بر سازمان‌های غیردولتی زیست محیطی در ایران (به‌عنوان نمونه مورد مطالعه) می‌باشد.